TCGA (The Cancer Genome Atlas) — NIH가 주도한 11,000명+ 암 환자 게놈 프로젝트. 33개 암 종류의 mutation/임상 데이터 공개.

본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%

용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = NeoVax 백신 우선 타겟

탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
선택된 암 (TCGA (The Cancer Genome Atlas)?)
SKCM
총 환자 수
438
표시된 genes?
50

SKCM Top mutated genes?

Rank Gene? 환자 수 % 환자 시각화 액션
1 TTN 351 80.1%
구조 보기
2 MUC16 325 74.2%
구조 보기
3 DNAH5 248 56.6%
구조 보기
4 BRAF 233 53.2%
구조 보기
5 PCLO 216 49.3%
구조 보기
6 LRP1B 205 46.8%
구조 보기
7 ADGRV1 198 45.2%
구조 보기
8 PKHD1L1 185 42.2%
구조 보기
9 DNAH7 179 40.9%
구조 보기
10 MGAM 176 40.2%
구조 보기
11 CSMD1 175 40.0%
구조 보기
12 CSMD2 174 39.7%
구조 보기
13 FAT4 171 39.0%
구조 보기
14 ANK3 167 38.1%
구조 보기
15 CSMD3 164 37.4%
구조 보기
16 RP1 163 37.2%
구조 보기
17 XIRP2 160 36.5%
구조 보기
18 HYDIN 159 36.3%
구조 보기
19 THSD7B 157 35.8%
구조 보기
20 DNAH9 156 35.6%
구조 보기
21 USH2A 156 35.6%
구조 보기
22 DNAH8 154 35.2%
구조 보기
23 DSCAM 151 34.5%
구조 보기
24 SYNE1 150 34.3%
구조 보기
25 FLG 150 34.3%
구조 보기
26 ZFHX4 146 33.3%
구조 보기
27 APOB 146 33.3%
구조 보기
28 RYR1 145 33.1%
구조 보기
29 MXRA5 143 32.7%
구조 보기
30 DNAH3 143 32.7%
구조 보기
31 PCDH15 141 32.2%
구조 보기
32 DNAH10 138 31.5%
구조 보기
33 MUC17 138 31.5%
구조 보기
34 COL4A4 138 31.5%
구조 보기
35 FAT3 137 31.3%
구조 보기
36 NEB 137 31.3%
구조 보기
37 SCN11A 133 30.4%
구조 보기
38 RYR2 132 30.1%
구조 보기
39 MROH2B 132 30.1%
구조 보기
40 UNC13C 128 29.2%
구조 보기
41 PTPRT 127 29.0%
구조 보기
42 SPHKAP 127 29.0%
구조 보기
43 OBSCN 127 29.0%
구조 보기
44 NRAS 125 28.5%
구조 보기
45 RYR3 124 28.3%
구조 보기
46 LRP2 124 28.3%
구조 보기
47 SPTA1 124 28.3%
구조 보기
48 SCN10A 123 28.1%
구조 보기
49 MYH2 122 27.9%
구조 보기
50 FAM135B 122 27.9%
구조 보기