TCGA (The Cancer Genome Atlas) — NIH가 주도한 11,000명+ 암 환자 게놈 프로젝트. 33개 암 종류의 mutation/임상 데이터 공개.

본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%

용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟

탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
선택된 암 (TCGA (The Cancer Genome Atlas)?)
BRCA
총 환자 수
1,009
표시된 genes?
50

BRCA Top mutated genes?

Rank Gene? 환자 수 % 환자 시각화 액션
1 TP53 347 34.4%
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2 PIK3CA 347 34.4%
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3 TTN 187 18.5%
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4 CDH1 130 12.9%
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5 GATA3 127 12.6%
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6 MUC16 109 10.8%
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7 KMT2C 99 9.8%
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8 MAP3K1 89 8.8%
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9 RYR2 66 6.5%
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10 FLG 66 6.5%
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11 SYNE1 63 6.2%
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12 USH2A 62 6.1%
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13 HMCN1 61 6.1%
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14 PTEN 58 5.8%
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15 SPTA1 54 5.4%
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16 ZFHX4 53 5.3%
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17 NEB 52 5.2%
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18 DMD 51 5.1%
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19 NCOR1 50 5.0%
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20 SYNE2 46 4.6%
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21 MUC4 46 4.6%
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22 MUC17 45 4.5%
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23 CSMD3 44 4.4%
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24 RYR3 44 4.4%
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25 OBSCN 44 4.4%
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26 FAT3 43 4.3%
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27 CSMD1 42 4.2%
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28 MAP2K4 42 4.2%
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29 MACF1 41 4.1%
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30 RUNX1 41 4.1%
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31 PKHD1L1 41 4.1%
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32 ARID1A 40 4.0%
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33 LRP2 39 3.9%
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34 HUWE1 39 3.9%
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35 ADGRV1 39 3.9%
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36 ABCA13 39 3.9%
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37 PCLO 38 3.8%
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38 NF1 38 3.8%
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39 DNAH11 38 3.8%
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40 CACNA1E 37 3.7%
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41 XIRP2 36 3.6%
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42 LRP1B 36 3.6%
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43 MDN1 36 3.6%
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44 DNAH17 36 3.6%
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45 APOB 36 3.6%
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46 MUC5B 35 3.5%
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47 RYR1 34 3.4%
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48 CSMD2 34 3.4%
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49 RELN 34 3.4%
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50 DST 33 3.3%
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