TCGA (The Cancer Genome Atlas) — NIH가 주도한 11,000명+ 암 환자 게놈 프로젝트. 33개 암 종류의 mutation/임상 데이터 공개.
본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%
용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟
탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%
용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟
탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
TCGA (The Cancer Genome Atlas)? 환자 mutation 탐색
5개 암 종류 × 2,568명 × top 50 Driver Mutation? genes (출처: cBioPortal?)
선택된 암 (TCGA (The Cancer Genome Atlas)?)
LUAD
총 환자 수
561
표시된 genes?
50
LUAD Top mutated genes?
| Rank | Gene? | 환자 수 | % 환자 | 시각화 | 액션 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | TP53 | 295 | 52.6% |
|
구조 보기 |
| 2 | TTN | 272 | 48.5% |
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| 3 | MUC16 | 242 | 43.1% |
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| 4 | CSMD3 | 226 | 40.3% |
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| 5 | RYR2 | 217 | 38.7% |
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| 6 | LRP1B | 201 | 35.8% |
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| 7 | ZFHX4 | 185 | 33.0% |
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| 8 | USH2A | 177 | 31.6% |
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| 9 | KRAS | 168 | 30.0% |
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| 10 | XIRP2 | 150 | 26.7% |
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| 11 | SPTA1 | 148 | 26.4% |
|
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| 12 | FLG | 145 | 25.9% |
|
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| 13 | CSMD1 | 125 | 22.3% |
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| 14 | NAV3 | 123 | 21.9% |
|
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| 15 | FAT3 | 121 | 21.6% |
|
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| 16 | COL11A1 | 120 | 21.4% |
|
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| 17 | PCDH15 | 118 | 21.0% |
|
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| 18 | ZNF536 | 117 | 20.9% |
|
구조 보기 |
| 19 | ANK2 | 111 | 19.8% |
|
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| 20 | MUC17 | 111 | 19.8% |
|
구조 보기 |
| 21 | PCLO | 109 | 19.4% |
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| 22 | RYR3 | 106 | 18.9% |
|
구조 보기 |
| 23 | APOB | 104 | 18.5% |
|
구조 보기 |
| 24 | KEAP1 | 102 | 18.2% |
|
구조 보기 |
| 25 | PAPPA2 | 101 | 18.0% |
|
구조 보기 |
| 26 | DNAH9 | 99 | 17.7% |
|
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| 27 | ADAMTS12 | 99 | 17.7% |
|
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| 28 | ADGRG4 | 98 | 17.5% |
|
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| 29 | RP1L1 | 97 | 17.3% |
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| 30 | TNR | 95 | 16.9% |
|
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| 31 | RYR1 | 95 | 16.9% |
|
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| 32 | FBN2 | 94 | 16.8% |
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| 33 | SI | 93 | 16.6% |
|
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| 34 | PTPRD | 92 | 16.4% |
|
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| 35 | NRXN1 | 92 | 16.4% |
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| 36 | CDH10 | 92 | 16.4% |
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| 37 | HMCN1 | 91 | 16.2% |
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| 38 | CACNA1E | 90 | 16.0% |
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| 39 | ZNF804A | 88 | 15.7% |
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| 40 | ABCA13 | 88 | 15.7% |
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| 41 | DMD | 87 | 15.5% |
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| 42 | ERICH3 | 87 | 15.5% |
|
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| 43 | NPAP1 | 87 | 15.5% |
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구조 보기 |
| 44 | PXDNL | 86 | 15.3% |
|
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| 45 | FAM135B | 86 | 15.3% |
|
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| 46 | FAT4 | 86 | 15.3% |
|
구조 보기 |
| 47 | RELN | 86 | 15.3% |
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| 48 | PCDH11X | 86 | 15.3% |
|
구조 보기 |
| 49 | NALCN | 85 | 15.2% |
|
구조 보기 |
| 50 | CSMD2 | 84 | 15.0% |
|
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