TCGA (The Cancer Genome Atlas) — NIH가 주도한 11,000명+ 암 환자 게놈 프로젝트. 33개 암 종류의 mutation/임상 데이터 공개.

본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%

용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟

탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
선택된 암 (TCGA (The Cancer Genome Atlas)?)
LUAD
총 환자 수
561
표시된 genes?
50

LUAD Top mutated genes?

Rank Gene? 환자 수 % 환자 시각화 액션
1 TP53 295 52.6%
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2 TTN 272 48.5%
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3 MUC16 242 43.1%
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4 CSMD3 226 40.3%
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5 RYR2 217 38.7%
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6 LRP1B 201 35.8%
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7 ZFHX4 185 33.0%
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8 USH2A 177 31.6%
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9 KRAS 168 30.0%
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10 XIRP2 150 26.7%
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11 SPTA1 148 26.4%
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12 FLG 145 25.9%
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13 CSMD1 125 22.3%
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14 NAV3 123 21.9%
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15 FAT3 121 21.6%
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16 COL11A1 120 21.4%
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17 PCDH15 118 21.0%
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18 ZNF536 117 20.9%
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19 ANK2 111 19.8%
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20 MUC17 111 19.8%
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21 PCLO 109 19.4%
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22 RYR3 106 18.9%
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23 APOB 104 18.5%
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24 KEAP1 102 18.2%
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25 PAPPA2 101 18.0%
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26 DNAH9 99 17.7%
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27 ADAMTS12 99 17.7%
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28 ADGRG4 98 17.5%
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29 RP1L1 97 17.3%
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30 TNR 95 16.9%
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31 RYR1 95 16.9%
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32 FBN2 94 16.8%
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33 SI 93 16.6%
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34 PTPRD 92 16.4%
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35 NRXN1 92 16.4%
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36 CDH10 92 16.4%
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37 HMCN1 91 16.2%
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38 CACNA1E 90 16.0%
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39 ZNF804A 88 15.7%
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40 ABCA13 88 15.7%
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41 DMD 87 15.5%
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42 ERICH3 87 15.5%
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43 NPAP1 87 15.5%
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44 PXDNL 86 15.3%
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45 FAM135B 86 15.3%
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46 FAT4 86 15.3%
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47 RELN 86 15.3%
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48 PCDH11X 86 15.3%
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49 NALCN 85 15.2%
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50 CSMD2 84 15.0%
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