AlphaFold 3 복합체 뷰어
Google DeepMind AlphaFold 3 — 단백질–약물·항원–MHC 등 생체분자 상호작용 구조 예측
AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.AlphaFold 2 → 3
Overview확장: AlphaFold 3 복합체
AF3는 단백질–단백질·DNA/RNA·리간드(약물)·항체–항원 상호작용 구조를 예측합니다. 표적치료 약물 결합·신생항원-MHC 제시를 구조 수준에서 해석.
단백질–약물 상호작용 (표적치료)
Protein–Ligand| 표적 단백질 | 변이 | 약물 | 기전 | 단량체 구조 | AF3 복합체 |
|---|---|---|---|---|---|
| BRAF | V600E | Vemurafenib / Dabrafenib | BRAF 억제제 — 활성 부위 결합 | 보기 | AF3 연동 시 |
| KRAS | G12C | Sotorasib / Adagrasib | G12C 공유결합 억제제 | 보기 | AF3 연동 시 |
| EGFR | L858R | Osimertinib | 3세대 EGFR-TKI | 보기 | AF3 연동 시 |
| KIT | D816V | Imatinib / Avapritinib | KIT 키나아제 억제제 | 보기 | AF3 연동 시 |
| IDH1 | R132H | Ivosidenib | mutant IDH1 억제제 | 보기 | AF3 연동 시 |
| MET | - | Capmatinib | MET exon14 억제제 | 보기 | AF3 연동 시 |
약물–표적 쌍은 임상적으로 확립된 표적치료 사실입니다. 복합체 결합 구조는 AF3 예측 결과(PDB) 연동 시 표시됩니다.
신생항원–MHC 제시 (백신)
Antigen–MHC
신생항원 펩타이드가 MHC?에 어떻게 제시되는지는 백신 설계의 핵심입니다. 현재 NeoFold는 NetMHCpan으로 결합 친화도를 점수화하며, AF3 연동 시 펩타이드–MHC 복합체 구조를 직접 예측해 제시 안정성을 구조 수준에서 검증할 수 있습니다.
AF3 복합체 연동 방법
Setup1. AlphaFold 3 서버/코드(비상업 연구용)로 복합체 구조 예측 → PDB/mmCIF 생성
2.
GENETIC_HEALTH_DIR/alphafold/complexes/에 배치 + 메타 등록3. 위 표의 "AF3 복합체" 열에서 3Dmol.js로 복합체(단백질+리간드/펩타이드) 직접 렌더
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