AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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IL5 — 2,546개 변이 (점수 높은 순, 21/51p)
변이병원성 확률분류3D
E108T 0.4840 불확실
A15Q 0.4836 불확실
W130S 0.4836 불확실
Y118H 0.4835 불확실
Q101G 0.4834 불확실
V30L 0.4833 불확실
N59E 0.4832 불확실
V112R 0.4830 불확실
Q61D 0.4829 불확실
I24W 0.4828 불확실
Q77M 0.4827 불확실
L5N 0.4813 불확실
R109L 0.4805 불확실
G106C 0.4801 불확실
S134I 0.4799 불확실
R110L 0.4797 불확실
N113F 0.4797 불확실
S92E 0.4793 불확실
K89W 0.4792 불확실
A28C 0.4785 불확실
H57Q 0.4775 불확실
E108S 0.4774 불확실
R41M 0.4773 불확실
A28W 0.4766 불확실
A14D 0.4764 불확실
H40S 0.4764 불확실
A35C 0.4759 불확실
K95E 0.4753 불확실
R2F 0.4750 불확실
G106H 0.4744 불확실
L10Y 0.4741 불확실
N127K 0.4737 불확실
R41S 0.4727 불확실
G106N 0.4723 불확실
E75H 0.4719 불확실
T128Y 0.4714 불확실
D117L 0.4714 불확실
S134F 0.4712 불확실
K31V 0.4703 불확실
V79W 0.4701 불확실
V112L 0.4695 불확실
G72M 0.4691 불확실
H60L 0.4685 불확실
L12H 0.4683 불확실
D99L 0.4678 불확실
N127A 0.4676 불확실
D117Q 0.4673 불확실
S92Q 0.4661 불확실
D117I 0.4654 불확실
Q101T 0.4637 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.