AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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TREM2 — 4,370개 변이 (점수 높은 순, 23/88p)
변이병원성 확률분류3D
Q53Y 0.5397 불확실
E2W 0.5395 불확실
W198P 0.5395 불확실
S40K 0.5389 불확실
Q25N 0.5389 불확실
Q222F 0.5388 불확실
S112C 0.5370 불확실
N99A 0.5367 불확실
G90I 0.5366 불확실
D39L 0.5366 불확실
R47C 0.5360 불확실
R47V 0.5359 불확실
E167W 0.5355 불확실
G91R 0.5355 불확실
L9N 0.5354 불확실
S81D 0.5349 불확실
V34M 0.5345 불확실
G115I 0.5337 불확실
L6D 0.5331 불확실
V12K 0.5326 불확실
F11D 0.5310 불확실
S158E 0.5305 불확실
W78P 0.5298 불확실
L71Q 0.5297 불확실
T22H 0.5293 불확실
E127H 0.5287 불확실
V12H 0.5285 불확실
R62F 0.5284 불확실
D137W 0.5267 불확실
G91A 0.5263 불확실
Q53G 0.5259 불확실
D39I 0.5255 불확실
L89G 0.5248 불확실
I175D 0.5224 불확실
V155Y 0.5224 불확실
A28Y 0.5223 불확실
E151W 0.5202 불확실
G45Y 0.5201 불확실
E146W 0.5199 불확실
H67K 0.5191 불확실
K123G 0.5183 불확실
W44Y 0.5183 불확실
G45I 0.5178 불확실
A83Y 0.5174 불확실
E151F 0.5173 불확실
L75T 0.5172 불확실
L177E 0.5171 불확실
M1W 0.5170 불확실
L71R 0.5166 불확실
R76D 0.5166 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.