AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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TREM2 — 4,370개 변이 (점수 높은 순, 31/88p)
변이병원성 확률분류3D
W198E 0.4069 불확실
S31F 0.4068 불확실
G58W 0.4067 불확실
N68M 0.4066 불확실
I8C 0.4064 불확실
H43W 0.4062 불확실
E127S 0.4062 불확실
D212M 0.4060 불확실
Q25I 0.4060 불확실
G200P 0.4057 불확실
S160M 0.4055 불확실
A195D 0.4049 불확실
S35Q 0.4047 불확실
I185Y 0.4045 불확실
A118K 0.4042 불확실
S73C 0.4041 불확실
C181W 0.4039 불확실
L193P 0.4037 불확실
L193S 0.4036 불확실
L107P 0.4035 불확실
W78D 0.4034 불확실
L224C 0.4031 불확실
A105L 0.4031 불확실
A180C 0.4029 불확실
K123L 0.4028 불확실
A105D 0.4028 불확실
A192Y 0.4026 불확실
R52L 0.4026 불확실
E151Y 0.4024 불확실
V12N 0.4020 불확실
Q33D 0.4016 불확실
V27P 0.4013 불확실
G45V 0.4010 불확실
Q101T 0.4008 불확실
R98I 0.4007 불확실
N99R 0.4005 불확실
L71A 0.4002 불확실
I175G 0.4000 불확실
T22N 0.3999 불확실
W44R 0.3998 불확실
A130Y 0.3989 불확실
V23Q 0.3989 불확실
D229C 0.3988 불확실
W194Y 0.3988 불확실
R77A 0.3987 불확실
R62C 0.3986 불확실
V63M 0.3982 불확실
L72A 0.3978 불확실
N20P 0.3976 불확실
A138C 0.3974 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.