AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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TSLP — 3,021개 변이 (점수 높은 순, 33/61p)
변이병원성 확률분류3D
K101T 0.3791 불확실
N64G 0.3791 불확실
M55T 0.3788 불확실
K136N 0.3785 불확실
L93R 0.3782 불확실
K95S 0.3780 불확실
G24R 0.3779 불확실
R72C 0.3775 불확실
L155C 0.3773 불확실
Y8M 0.3771 불확실
K40A 0.3771 불확실
L6Y 0.3770 불확실
Q21P 0.3767 불확실
F2G 0.3767 불확실
F18T 0.3766 불확실
Q159M 0.3766 불확실
V67E 0.3762 불확실
S68D 0.3760 불확실
K136A 0.3759 불확실
E78T 0.3749 불확실
T58F 0.3747 불확실
L6H 0.3743 불확실
P73V 0.3739 불확실
V67K 0.3733 불확실
L6K 0.3726 불확실
R150C 0.3725 불확실
T61G 0.3712 불확실
R15H 0.3712 불확실
F151Y 0.3705 불확실
K49L 0.3705 불확실
A107Q 0.3702 불확실
S48E 0.3699 불확실
L138H 0.3691 불확실
R153V 0.3687 불확실
T121I 0.3687 불확실
K59V 0.3682 불확실
I39V 0.3680 불확실
M97G 0.3680 불확실
W109Q 0.3678 불확실
K95G 0.3676 불확실
Q145G 0.3675 불확실
S60M 0.3666 불확실
V141A 0.3664 불확실
F18A 0.3663 불확실
E139V 0.3657 불확실
A42H 0.3652 불확실
K16M 0.3649 불확실
K59A 0.3646 불확실
V23L 0.3645 불확실
S142F 0.3642 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.