ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
ASPM: AM vs ClinVar 일치도
500 변이✓ 둘 다 병원성
2
✓ 둘 다 양성
25
⚠ CV=병원성 / AM=양성
0
⚠ CV=양성 / AM=병원성
0
— AM 미적재
473
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 27건 중 27건 일치 / 0건 불일치 — 일치도 100%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| C1732* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C236* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C974* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1266* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1455* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E216* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2333* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2585* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2731* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E452* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E456* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E924* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E983* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| I851F | Likely pathogenic | 0.548 | ambiguous | 해석 → | |
| K1077* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K3080* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K3222* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K993E | Conflicting classifications of pathogeni | 0.109 | benign | 해석 → | |
| L1023* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L1063* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L198* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L2350* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L2907* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L3035* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L3214* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L391* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L707* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| M1T | Likely pathogenic | 0.637 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| Q1274* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1347* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1355* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1461* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1472* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1574* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1736* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1823* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q193* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2013* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2028* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2190* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2270* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2307* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2310* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2369* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2538* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2609* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2667* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2673* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2756* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q2902* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q3060* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q3292* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q3321* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q380* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q955* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1019* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R117* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1271* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1327* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1392* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1538* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1578* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1599* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1617* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1722* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1745* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2078* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2332* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R243* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2442* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2470* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2515* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2682* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2700* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R2743* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3031* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3064* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3096* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3107* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3152* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3233* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3244* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3281* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3304* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3308L | Likely pathogenic | 0.704 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| R3354* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R3390* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R597* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R797* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R931* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R980* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S1176* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S1237* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S2466* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S3186* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S566* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W1277* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W1326* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W1395* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W1456* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W1456* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W1474* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W1934* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W2943* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W2964* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W2968* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W3150* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W3215* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W3220* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W695* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W803* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W989* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1109* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1325* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1569* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1602* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1665* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1712* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1844* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2063* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2208* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2236* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2587* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2658* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2658* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2708* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y2882* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y3164* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y3263* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y462* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y558* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y832* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A1122T | Uncertain significance | 0.107 | benign | 해석 → | |
| A1125V | Uncertain significance | 0.126 | benign | 해석 → | |
| A1258T | Conflicting classifications of pathogeni | 0.089 | benign | 해석 → | |
| A1296P | Conflicting classifications of pathogeni | 0.812 | pathogenic | 해석 → | |
| A1296T | Uncertain significance | 0.215 | benign | 해석 → | |
| A1296V | Uncertain significance | 0.278 | benign | 해석 → | |
| A1302S | Uncertain significance | 0.121 | benign | 해석 → | |
| A1319S | Uncertain significance | 0.120 | benign | 해석 → | |
| A1350T | Uncertain significance | 0.139 | benign | 해석 → | |
| A1386S | Uncertain significance | 0.159 | benign | 해석 → | |
| A1386V | Uncertain significance | 0.293 | benign | 해석 → | |
| A1406F | Uncertain significance | 0.484 | ambiguous | 해석 → | |
| A1406T | Uncertain significance | 0.158 | benign | 해석 → | |
| A1468T | Uncertain significance | 0.113 | benign | 해석 → | |
| A1503T | Uncertain significance | 0.113 | benign | 해석 → | |
| A1546T | Uncertain significance | 0.091 | benign | 해석 → | |
| A1553T | Uncertain significance | 0.105 | benign | 해석 → | |
| A1618T | Uncertain significance | 0.143 | benign | 해석 → | |
| A1681T | Uncertain significance | 0.131 | benign | 해석 → | |
| A1737E | Uncertain significance | 0.615 | pathogenic | 해석 → | |
| A1737T | Uncertain significance | 0.153 | benign | 해석 → | |
| A1754T | Uncertain significance | 0.174 | benign | 해석 → | |
| A1767P | Conflicting classifications of pathogeni | 0.407 | ambiguous | 해석 → | |
| A1787E | Uncertain significance | 0.344 | ambiguous | 해석 → | |
| A1790P | Uncertain significance | 0.369 | ambiguous | 해석 → | |
| A1790T | Uncertain significance | 0.089 | benign | 해석 → | |
| A1827T | Uncertain significance | 0.172 | benign | 해석 → | |
| A1860S | Uncertain significance | 0.100 | benign | 해석 → | |
| A1860V | Benign | 0.122 | benign | ✓ | 해석 → |
| A1876T | Uncertain significance | 0.078 | benign | 해석 → | |
| A1876V | Uncertain significance | 0.095 | benign | 해석 → | |
| A1877S | Benign | 0.132 | benign | ✓ | 해석 → |
| A1877T | Benign/Likely benign | 0.140 | benign | ✓ | 해석 → |
| A1900D | Uncertain significance | 0.492 | ambiguous | 해석 → | |
| A1901T | Uncertain significance | 0.171 | benign | 해석 → | |
| A1907V | Uncertain significance | 0.121 | benign | 해석 → | |
| A1913T | Uncertain significance | 0.115 | benign | 해석 → | |
| A1923T | Uncertain significance | 0.179 | benign | 해석 → | |
| A1933T | Uncertain significance | 0.227 | benign | 해석 → | |
| A194D | Benign/Likely benign | 0.432 | ambiguous | 해석 → | |
| A1950V | Uncertain significance | 0.159 | benign | 해석 → | |
| A1997V | Likely benign | 0.118 | benign | ✓ | 해석 → |
| A2022T | Uncertain significance | 0.095 | benign | 해석 → | |
| A2030T | Uncertain significance | 0.115 | benign | 해석 → | |
| A2046T | Uncertain significance | 0.173 | benign | 해석 → | |
| A2125D | Uncertain significance | 0.449 | ambiguous | 해석 → | |
| A2192V | Uncertain significance | 0.265 | benign | 해석 → | |
| A2248S | Uncertain significance | 0.132 | benign | 해석 → | |
| A2266T | Uncertain significance | 0.249 | benign | 해석 → | |
| A2266V | Uncertain significance | 0.399 | ambiguous | 해석 → | |
| A2289S | Uncertain significance | 0.125 | benign | 해석 → | |
| A22P | Uncertain significance | 0.103 | benign | 해석 → | |
| A2337V | Uncertain significance | 0.271 | benign | 해석 → | |
| A2338V | Uncertain significance | 0.285 | benign | 해석 → | |
| A234T | Uncertain significance | 0.067 | benign | 해석 → | |
| A2443V | Uncertain significance | 0.366 | ambiguous | 해석 → | |
| A2539G | Uncertain significance | 0.208 | benign | 해석 → | |
| A2556V | Likely benign | 0.347 | ambiguous | 해석 → | |
| A2579T | Uncertain significance | 0.207 | benign | 해석 → | |
| A2668T | Uncertain significance | 0.151 | benign | 해석 → | |
| A2668V | Uncertain significance | 0.272 | benign | 해석 → | |
| A2691V | Uncertain significance | 0.282 | benign | 해석 → | |
| A2817D | Uncertain significance | 0.170 | benign | 해석 → | |
| A2817S | Conflicting classifications of pathogeni | 0.123 | benign | 해석 → | |
| A2818S | Conflicting classifications of pathogeni | 0.121 | benign | 해석 → | |
| A2863S | Uncertain significance | 0.150 | benign | 해석 → | |
| A2895T | Uncertain significance | 0.138 | benign | 해석 → | |
| A2899V | Uncertain significance | 0.121 | benign | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.