ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
BRCA2: AM vs ClinVar 일치도
500 변이✓ 둘 다 병원성
39
✓ 둘 다 양성
3
⚠ CV=병원성 / AM=양성
8
⚠ CV=양성 / AM=병원성
1
— AM 미적재
449
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 51건 중 42건 일치 / 9건 불일치 — 일치도 82.4%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| A1725* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A2231* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A2603P | Likely pathogenic | 0.986 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| A2730P | Likely pathogenic | 0.965 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| A2730T | Uncertain significance | 0.166 | benign | 해석 → | |
| A2780D | Likely pathogenic | 0.939 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| A2911E | Uncertain significance | 0.317 | benign | 해석 → | |
| A2951S | Likely benign | 0.193 | benign | ✓ | 해석 → |
| A2951T | Benign | 0.147 | benign | ✓ | 해석 → |
| A3028P | Pathogenic/Likely pathogenic | 0.662 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| A3122P | Likely pathogenic | 0.958 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| A622* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A938P | Pathogenic | 0.154 | benign | ⚠ | 해석 → |
| C1159* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1200* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1265* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1290* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1290* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C132* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1365* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C138* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1399* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C148* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C161* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1654* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1675* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1809* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1820* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1885* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1893* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1913* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1948* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1958* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1960* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1975* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2117* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2256* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2422* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2473* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2549* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2636* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2689* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2765* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C2817* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C3069* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C3097* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C3173* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C3233* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C3253* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C341* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C393* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C419* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C480* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C554* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C616* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C711* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C717* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C738* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C822* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C916* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1451* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1469* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1547* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D156* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1618* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D189G | Conflicting classifications of pathogeni | 0.881 | pathogenic | 해석 → | |
| D191G | Conflicting classifications of pathogeni | 0.371 | ambiguous | 해석 → | |
| D191V | Conflicting classifications of pathogeni | 0.483 | ambiguous | 해석 → | |
| D2110* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D23N | Uncertain significance | 0.335 | benign | 해석 → | |
| D23Y | Pathogenic/Likely pathogenic | 0.523 | ambiguous | 해석 → | |
| D2438* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D244* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D2489* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D2611G | Conflicting classifications of pathogeni | 0.843 | pathogenic | 해석 → | |
| D2661V | Conflicting classifications of pathogeni | 0.940 | pathogenic | 해석 → | |
| D2665* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D2679Y | Uncertain significance | 0.877 | pathogenic | 해석 → | |
| D2723A | Pathogenic | 0.971 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| D2723E | Conflicting classifications of pathogeni | 0.961 | pathogenic | 해석 → | |
| D2723G | Pathogenic | 0.951 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| D2723H | Pathogenic | 0.987 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| D2723N | Conflicting classifications of pathogeni | 0.821 | pathogenic | 해석 → | |
| D2723V | Pathogenic/Likely pathogenic | 0.982 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| D2733V | Conflicting classifications of pathogeni | 0.903 | pathogenic | 해석 → | |
| D2819G | Conflicting classifications of pathogeni | 0.693 | pathogenic | 해석 → | |
| D2819V | Conflicting classifications of pathogeni | 0.678 | pathogenic | 해석 → | |
| D2983V | Conflicting classifications of pathogeni | 0.119 | benign | 해석 → | |
| D3073G | Conflicting classifications of pathogeni | 0.941 | pathogenic | 해석 → | |
| D3073Y | Conflicting classifications of pathogeni | 0.896 | pathogenic | 해석 → | |
| D3095E | Pathogenic | 0.837 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| D3095E | Pathogenic/Likely pathogenic | 0.837 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| D3095G | Conflicting classifications of pathogeni | 0.692 | pathogenic | 해석 → | |
| D3095V | Conflicting classifications of pathogeni | 0.889 | pathogenic | 해석 → | |
| D750* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D752* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| D935* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1016* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1021* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1035* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1036* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1046* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1110* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1113* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1113* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1120* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1126* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1143* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1146* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1157* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1157* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1158* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1183* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1211* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1213* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1250* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1276* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1285* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1299* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E13* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E13* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1308* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1320* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1335* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1353* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1375* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1382* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1391* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1407* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1415* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1422* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1422* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1441* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1455* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1456* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1465* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1481* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1482* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1511* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1514* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1518* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1537* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1550* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1577* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1581* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1581* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1608* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1641* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1646* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1688* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1695* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1703* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1726* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1734* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1755* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1773* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1806* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1812* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E182* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1838* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1838* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1857* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1876* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1879* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1912* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1927* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1928* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1940* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1953* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2004* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2020* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2028* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2029* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2070* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2082* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2121* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2129* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2139* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E215* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E218* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2183* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2198* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2210* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2220* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2226* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2229* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2236* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2239* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2261* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2298* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2301* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2328* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2340* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2355* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2364* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E238* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E238* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2391* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2420* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E2430* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.