ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
HTR2A: AM vs ClinVar 일치도
31 변이✓ 둘 다 병원성
0
✓ 둘 다 양성
1
⚠ CV=병원성 / AM=양성
0
⚠ CV=양성 / AM=병원성
0
— AM 미적재
30
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 1건 중 1건 일치 / 0건 불일치 — 일치도 100%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| A230T | Uncertain significance | 0.092 | benign | 해석 → | |
| A447T | Uncertain significance | 0.064 | benign | 해석 → | |
| A447V | Likely benign | 0.074 | benign | ✓ | 해석 → |
| D31Y | Uncertain significance | 0.067 | benign | 해석 → | |
| D435H | Uncertain significance | 0.091 | benign | 해석 → | |
| D462E | Uncertain significance | 0.077 | benign | 해석 → | |
| E355K | Uncertain significance | 0.062 | benign | 해석 → | |
| F43I | Uncertain significance | 0.070 | benign | 해석 → | |
| F43V | Uncertain significance | 0.072 | benign | 해석 → | |
| H452P | Uncertain significance | 0.066 | benign | 해석 → | |
| I3F | Uncertain significance | 0.058 | benign | 해석 → | |
| K400R | Uncertain significance | 0.067 | benign | 해석 → | |
| M312V | Uncertain significance | 0.093 | benign | 해석 → | |
| N54H | Uncertain significance | 0.076 | benign | 해석 → | |
| P303L | Uncertain significance | 0.090 | benign | 해석 → | |
| Q313K | Uncertain significance | 0.278 | benign | 해석 → | |
| Q425H | Uncertain significance | 0.106 | benign | 해석 → | |
| R140Q | Uncertain significance | 0.067 | benign | 해석 → | |
| R185H | Uncertain significance | 0.272 | benign | 해석 → | |
| R275Q | Uncertain significance | 0.093 | benign | 해석 → | |
| R393W | Uncertain significance | 0.712 | pathogenic | 해석 → | |
| S29T | Uncertain significance | 0.069 | benign | 해석 → | |
| T160M | Uncertain significance | 0.750 | pathogenic | 해석 → | |
| T274I | Uncertain significance | 0.126 | benign | 해석 → | |
| T307I | Uncertain significance | 0.103 | benign | 해석 → | |
| V175I | Uncertain significance | 0.064 | benign | 해석 → | |
| V379A | Uncertain significance | 0.900 | pathogenic | 해석 → | |
| W76C | Uncertain significance | 0.956 | pathogenic | 해석 → | |
| A176S | - | 0.596 | pathogenic | 해석 → | |
| G138V | - | 0.770 | pathogenic | 해석 → | |
| G205C | - | 0.172 | benign | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.