ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
MUC5AC: AM vs ClinVar 일치도
10 변이✓ 둘 다 병원성
0
✓ 둘 다 양성
1
⚠ CV=병원성 / AM=양성
0
⚠ CV=양성 / AM=병원성
0
— AM 미적재
9
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 1건 중 1건 일치 / 0건 불일치 — 일치도 100%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| A2271S | Uncertain significance | 0.071 | benign | 해석 → | |
| A2471P | Uncertain significance | 0.100 | benign | 해석 → | |
| A3633V | Uncertain significance | 0.116 | benign | 해석 → | |
| E4872G | Uncertain significance | 0.349 | ambiguous | 해석 → | |
| N5007S | Likely benign | 0.073 | benign | ✓ | 해석 → |
| P3434L | Uncertain significance | 0.246 | benign | 해석 → | |
| R1201W | Uncertain significance | 0.098 | benign | 해석 → | |
| R1820Q | Uncertain significance | 0.131 | benign | 해석 → | |
| T3155S | Uncertain significance | 0.136 | benign | 해석 → | |
| T4843N | Uncertain significance | 0.108 | benign | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.