ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
PPARG: AM vs ClinVar 일치도
148 변이✓ 둘 다 병원성
3
✓ 둘 다 양성
0
⚠ CV=병원성 / AM=양성
0
⚠ CV=양성 / AM=병원성
0
— AM 미적재
145
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 3건 중 3건 일치 / 0건 불일치 — 일치도 100%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| A231E | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C160S | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E127A | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E127G | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E416* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| F358L | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| G118E | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| I294T | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K317* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L148P | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L307P | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L375P | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L421P | Likely pathogenic | 0.999 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| L92P | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| P184L | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| P465L | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| P83Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q281* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q284P | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R164Q | Likely pathogenic | 1.000 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| R164W | Pathogenic | 1.000 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| R182Q | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R182W | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R210P | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R286H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R355* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R395C | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R395H | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| V288M | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y121C | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y86* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A207T | Uncertain significance | 0.999 | pathogenic | 해석 → | |
| A233V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A61T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C109R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C129G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D144G | Uncertain significance | 1.000 | pathogenic | 해석 → | |
| D19A | Uncertain significance | 0.086 | benign | 해석 → | |
| D19E | Uncertain significance | 0.085 | benign | 해석 → | |
| D200N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D249V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D25N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D311N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D3N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D50H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D62N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E187D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E322K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E349K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E416G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E425A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E425G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E49K | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| F13L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F280S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F372L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G113R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G128V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G131V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G336R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H120R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H153Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H26D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H26Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I142T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I15F | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| I234T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I301V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I339T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I407M | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K130M | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K140N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K402N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K420Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K432R | Uncertain significance | 0.131 | benign | 해석 → | |
| K455R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L209F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L328P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L331F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L391V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L440F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L474S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L67V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M105I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M105V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M255L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M362V | Uncertain significance | 0.469 | ambiguous | 해석 → | |
| N102T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N203T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N251S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N310D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N333S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N410H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P10A | Benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| P225L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P267H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P267L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P302L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P357S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P424A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P52A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q269R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q271K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q271R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q418H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q91E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R110H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R134P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R138I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R145S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R151Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R210Q | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| R278C | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R355Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S156G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S174P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S197N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S287P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S353D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S353R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S380R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S426F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S462R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T457M | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T45A | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| T45P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T54P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T90S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| V111I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| V22I | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| V246I | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| V291L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| V305I | Uncertain significance | 0.116 | benign | 해석 → | |
| V305L | Conflicting classifications of pathogeni | 0.413 | ambiguous | 해석 → | |
| V320I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| V448G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| V453A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y143C | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y248H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D31Y | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| E425* | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| G282C | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| I279F | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| M250I | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| S197G | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| T445M | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| V38F | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| V60G | - | — | 미적재 | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.