ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
TBX3: AM vs ClinVar 일치도
334 변이✓ 둘 다 병원성
5
✓ 둘 다 양성
0
⚠ CV=병원성 / AM=양성
0
⚠ CV=양성 / AM=병원성
0
— AM 미적재
329
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 5건 중 5건 일치 / 0건 불일치 — 일치도 100%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| C140R | Likely pathogenic | 1.000 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| E381* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| I125N | Likely pathogenic | 1.000 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| K273* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| P134A | Likely pathogenic | 0.999 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| Q331* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q475* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R290* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| V124F | Likely pathogenic | 1.000 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| W113G | Likely pathogenic | 1.000 | pathogenic | ✓ | 해석 → |
| W170* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A158T | Uncertain significance | 0.817 | pathogenic | 해석 → | |
| A16P | Uncertain significance | 0.884 | pathogenic | 해석 → | |
| A16S | Uncertain significance | 0.437 | ambiguous | 해석 → | |
| A192T | Uncertain significance | 0.948 | pathogenic | 해석 → | |
| A29V | Uncertain significance | 0.487 | ambiguous | 해석 → | |
| A325T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A325V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A330T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A332V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A336V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A337T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A357P | Uncertain significance | 0.109 | benign | 해석 → | |
| A359G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A359T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A359V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A391G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A391V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A394P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A398T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A420S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A431V | Uncertain significance | 0.082 | benign | 해석 → | |
| A43T | Uncertain significance | 0.109 | benign | 해석 → | |
| A443T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A443V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A450V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A452G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A452T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A458G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A460T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A468T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A468V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A470T | Uncertain significance | 0.065 | benign | 해석 → | |
| A471E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A471G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A471T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A474V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A484N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A484T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A488T | Uncertain significance | 0.075 | benign | 해석 → | |
| A488V | Uncertain significance | 0.104 | benign | 해석 → | |
| A515V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A517P | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| A517T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A51T | Uncertain significance | 0.103 | benign | 해석 → | |
| A529P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A52V | Uncertain significance | 0.183 | benign | 해석 → | |
| A542T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A542V | Benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| A546G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A546V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A547S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A553P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A553T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A555T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A568T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A590T | Benign/Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| A591V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A597P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A597V | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| A599T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A639T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A644V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A645V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A646V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A647E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A656T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A659D | Uncertain significance | 0.485 | ambiguous | 해석 → | |
| A692V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A696V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A71S | Uncertain significance | 0.124 | benign | 해석 → | |
| A721G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A721P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A721T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A85E | Uncertain significance | 0.482 | ambiguous | 해석 → | |
| A85G | Uncertain significance | 0.095 | benign | 해석 → | |
| A85V | Uncertain significance | 0.146 | benign | 해석 → | |
| C140Y | Uncertain significance | 0.999 | pathogenic | 해석 → | |
| C370Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C384S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D114V | Uncertain significance | 0.708 | pathogenic | 해석 → | |
| D347Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D409E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D414E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D414N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D667E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D667G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D716N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D7E | Uncertain significance | 0.176 | benign | 해석 → | |
| D7Y | Uncertain significance | 0.718 | pathogenic | 해석 → | |
| E358Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E360D | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| E360Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E363K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E368K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E440Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E449Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E693D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E73Q | Uncertain significance | 0.391 | ambiguous | 해석 → | |
| E94G | Likely benign | 0.515 | ambiguous | 해석 → | |
| E94V | Uncertain significance | 0.560 | ambiguous | 해석 → | |
| E96K | Uncertain significance | 0.759 | pathogenic | 해석 → | |
| F397S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F483S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F493C | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F493V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F577L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G129R | Uncertain significance | 1.000 | pathogenic | 해석 → | |
| G353V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G366V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G366V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G406R | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| G441D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G455D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G455S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G455V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G476V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G480V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G495E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G509A | Uncertain significance | 0.135 | benign | 해석 → | |
| G520S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G532R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G549R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G578R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G632S | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| G652D | Uncertain significance | 0.306 | benign | 해석 → | |
| G652S | Uncertain significance | 0.056 | benign | 해석 → | |
| G652V | Uncertain significance | 0.137 | benign | 해석 → | |
| G70R | Uncertain significance | 0.871 | pathogenic | 해석 → | |
| G710C | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H187D | Uncertain significance | 1.000 | pathogenic | 해석 → | |
| H18R | Uncertain significance | 0.921 | pathogenic | 해석 → | |
| H205Y | Uncertain significance | 0.968 | pathogenic | 해석 → | |
| H217R | Uncertain significance | 0.978 | pathogenic | 해석 → | |
| H309Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H365R | Benign/Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| H395P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H417R | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| H561R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H565Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H604R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H606Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I155V | Uncertain significance | 0.531 | ambiguous | 해석 → | |
| I186V | Uncertain significance | 0.914 | pathogenic | 해석 → | |
| I234V | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| I274T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I625M | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I625N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K200R | Uncertain significance | 0.436 | ambiguous | 해석 → | |
| K242R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K310E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K374T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K387N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K410E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K653T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L21P | Uncertain significance | 0.623 | pathogenic | 해석 → | |
| L243I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L252F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L252F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L297V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L348F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L3R | Uncertain significance | 0.193 | benign | 해석 → | |
| L453V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L498F | Uncertain significance | 0.112 | benign | 해석 → | |
| L611M | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| L611V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L650P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L657M | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L657V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L690P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L690V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L701V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M153L | Uncertain significance | 0.600 | pathogenic | 해석 → | |
| M153V | Uncertain significance | 0.840 | pathogenic | 해석 → | |
| M171L | Uncertain significance | 0.913 | pathogenic | 해석 → | |
| M171L | Uncertain significance | 0.913 | pathogenic | 해석 → | |
| M198T | Uncertain significance | 0.995 | pathogenic | 해석 → | |
| M1I | Uncertain significance | 0.692 | pathogenic | 해석 → | |
| M225R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M225V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M302V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M507V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M514V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M519T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M541V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M574T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M588L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M588R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M588V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M614V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.