ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
TRPS1: AM vs ClinVar 일치도
500 변이✓ 둘 다 병원성
0
✓ 둘 다 양성
4
⚠ CV=병원성 / AM=양성
0
⚠ CV=양성 / AM=병원성
0
— AM 미적재
496
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 4건 중 4건 일치 / 0건 불일치 — 일치도 100%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| A932T | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A932V | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1233Y | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C348F | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C351* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C909S | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C909Y | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| C933Y | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| E593* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1060* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| H1246L | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| H1246Q | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| H590A | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K390* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K394* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K394* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K463* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K521* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K792* | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K922E | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K938Q | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| K964E | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L363* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L919P | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| L919V | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| N393* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| N911S | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1118* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q1262* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q184* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q233* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q293* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q305* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q32* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q322* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q365* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q438* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q564* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q565* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q628* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q718* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q730* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q732* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q834* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q836* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q881* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q956* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q975* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q987* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R1077* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R257* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R544* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R624* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R696* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R853* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R921* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R921P | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R921Q | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R965C | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| R965H | Pathogenic/Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S1066* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S388* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S458* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S461* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S503* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S606F | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S633* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S818* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S886* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| S941* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| T914P | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| V929G | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W410* | Likely pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W410* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W794* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W807* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| W807* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1105* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y1154* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y856* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y936* | Pathogenic | — | 미적재 | 해석 → | |
| A1088G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A1088V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A1168S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A1180V | Uncertain significance | 0.139 | benign | 해석 → | |
| A130P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A131S | Likely benign | 0.075 | benign | ✓ | 해석 → |
| A153T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A196T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A196V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A226P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A271V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A377V | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| A385E | Uncertain significance | 0.168 | benign | 해석 → | |
| A385G | Likely benign | 0.090 | benign | ✓ | 해석 → |
| A619V | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| A661V | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| A714T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A810E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A822G | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| A848T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A849T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A852E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A871T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A878T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A885V | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| A91T | Benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1230Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1233R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C154Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C449Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C541R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C600Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C681R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C704S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C909R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C912F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C930G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C930R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C933R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1061G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1122N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1122V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1172G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1172H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D1239E | Uncertain significance | 0.185 | benign | 해석 → | |
| D1239G | Uncertain significance | 0.514 | ambiguous | 해석 → | |
| D151Y | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D166N | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| D205G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D274E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D338N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D406G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D434N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D486G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D486N | Benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| D498E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D552H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D656V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D656Y | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| D733G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D742E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D766A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D842N | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1003G | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1018K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E102K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E1207G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E145D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E175K | Benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| E30A | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| E30K | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| E362K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E40D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E466K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E466Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E529K | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| E57G | Benign/Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| E588G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E651K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E660G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E691K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E71G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E741G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E751A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E751Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E752D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E784A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E835K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E861K | Uncertain significance | 0.333 | benign | 해석 → | |
| E969D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E985A | Uncertain significance | 0.208 | benign | 해석 → | |
| F1108C | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F1112L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F1112V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F1117S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F1256L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F350S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F451L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| F644L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1063E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1063R | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| G108E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1170A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1192S | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1234D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1251S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1278A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1278S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G189S | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| G207V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G262R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G317E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G408A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G473R | Conflicting classifications of pathogeni | — | 미적재 | 해석 → | |
| G479S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G557V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G788R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G815V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G857S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.